在江戶經營萬事屋的坂田銀時，因緣際會結識了以扒手為生的孤兒晴太。晴太正在尋找失散多年的母親，而她極有可能就是身處於凌駕法律之上的地下城市吉原的花魁日輪。
吉原的花魁們都受到夜王鳳仙的支配，鳳仙在戰鬥民族「夜兔族」中以壓倒性的力量自豪，擁有巨額的財富和權力，並完全控制著整個吉原。為了實現少年的心願，銀時一行人決定展開行動。他們之間的聯繫能否照亮這片巨大的黑暗呢？