來歷不明的外星生物侵襲地球，吞食大腦，寄生人體模擬人類行為，大規模繁衍寄生獸…

寄生獸田宮良子（深津繪里 飾）深信能與人類和平共存，嘗試懷孕生子，迎接新時代降臨。以市長廣川（北川一輝　飾）為首的寄生生物卻擴張領域，企圖稱霸世界。另一方面，人類也組織特殊部隊，設立秘密指揮基地，準備突襲，一舉殲滅寄生獸；隨著日本步步淪陷，兩個物種之間的大戰，逐步走向白熱化！

與「米奇」（阿部貞夫　聲演）意外合體的高中生新一（染谷將太　飾），自母親被殺後，對寄生獸的仇恨與日俱增，為了保護家人與朋友，豁出一切奮力反擊。然而，靜待他的是前所未有力量最強的寄生獸後藤（淺野忠信　飾）…

物競天擇，適者生存，人類主宰食物鏈最上層的時代會否從此改寫？充滿矛盾與衝突的生存之戰，一觸即發！